Третье издание учебника существенно переработано и дополнено в связи с новыми достижениями биологии, микробиологии, экологии и изменившимися представлениями об охране окружающей среды и роли почвенной биоты в этом процессе. В учебнике дается представление о всех основных группах организмов, составляющих почвенную биоту: растениях, водорослях, почвенных животных, грибах, лишайниках, бактериях, вирусах и фагах. Подробно рассматривается участие почвенных организмов в круговороте веществ в потоках энергии, а также в почвообразовательных процессах.
Рассматриваются экологические аспекты биологии почв: специфика почвы как среды обитания организмов, микро- и мезозональность, аутэкология, популяционная экология, экология сообществ, сукцессия, вертикальное распределение организмов в наземных экосистемах, эколого-географические закономерности распространения организмов, роль почвенной биоты в охране окружающей среды, поддержании чистоты грунтовых вод и атмосферы.
Особое внимание уделено микроорганизмам как наиболее важному звену почвенной биоты. Подчеркивается значение взаимодействия разных групп организмов, особенно микроорганизмов и растений, зоомикробных комплексов, ассоциаций грибов с водорослями и бактериями для нормального функционирования почвенной биоты.