Актуальность изучения Великих озер Европы и их отложений связана с изучением геологического строения, истории развития, нынешнего состояния и прогноза их дальнейшего изменения. При масштабных объемах работ, проводящихся на территории шельфа в погоне за поиском и добычей углеводородов, такие огромные водоемы, как Онежское и Ладожское озера, остаются практически неизученными, хотя они ощутимо влияют на жизнь близлежащих населенных пунктов и экологическое состояние региона целом. Основополагающим их значением является тот факт, что эти озера являются крупнейшими резервуаром питьевых вод. Знание истории их развития позволяет оценивать сохранение первичных качеств этой воды и прогнозировать ухудшение или сохранение её запаса.

В Атласе представлены результаты многолетних комплексных исследований Онежского озера, выполненных в рамках программ Отделения наук о Земле РАН, Институтом водных проблем Севера Карельского научного центра РАН при участии Института геологии КарНЦ РАН и Института озероведения РАН. В качестве прототипа был выбран атлас Ладожского озера (Ладожское озеро, 2002). В Атласе представлены схемы, диаграммы, графики, профили и тексты, которые показывают особенности формирования котловины озера и водосбора, современное состояние климата на водосборе, гидрологических и гидрофизических процессов и явлений, биоты и гидрохимических особенностей озера и водных объектов водосбора, а также донных отложений. Последняя глава Атласа, подготовленная по гранту РГО, посвящена памятникам природы, культуры и истории. Большое внимание уделено практическому использованию вод озера, водному хозяйству, а также рекреационным особенностям озера и водосбора. Материалы Атласа представляют интерес для практического использования ресурсов озера и водосбора, а также научных и учебных целей.
Подавляющее число статей написано сотрудниками ИВПС КарНЦ РАН, поэтому после фамилии автора не приводится  название института. В статьях Атласа, написанных не сотрудниками Института водных проблем Севера КарНЦ РАН, дано название организации, в которой работает автор

Учебное пособие подготовлено коллективом авторов на основе проведенных ими научных исследований. В нем представлена информация по географии, гидрологии, геологии, гидробиологии, гидрохимии водоемов г. Петрозаводска, включая результаты работ, описание методик, картографический и иллюстрационный материалы.
Учебное пособие предназначено для учителей и учащихся средних школ, студентов вузов, представителей административных структур и всех неравнодушных к состоянию окружающей среды граждан. Коллектив авторов выражает надежду, что их труд поможет реализации различных программ, направленных на устойчивое использование и охрану водных объектов Республики Карелия.